裸甲藻的进化历史复杂，被认为是并系群。裸甲藻物种及其更高分类阶元之间的系统发育关系远未解决。我们从南海分离单细胞或包囊建立了6个裸甲藻株系，对其形态和超微结构进行了仔细研究，并获得了核糖体DNA序列。两个沙栖裸甲藻株系被归到新属和新种—三亚赫尔伯特藻（Hulburtia sanyaensis），该藻株具有明显的不动阶段和半圆形的顶端结构复合体（ASC）。不动阶段通过二分裂进行无性繁殖，形成多达16个细胞的聚集体。该种在日本鹿儿岛也有记录。其他藻株被鉴定为Pseudocochlodinium profundisulcus和Grammatodinium tongyeonginum。在P. profundisulcus中观察到细胞核膜具有腔室，但在另外两个物种中未发现。来自中国的G. tongyeonginum与来自韩国的株系在SSU区域具有96.37%的序列相似性。基于SSU、ITS和LSU rDNA的串接序列，采用最大似然法和贝叶斯推断推测了分子系统发育。P. profundisulcus被归到狭义的裸甲藻科，而三亚赫尔伯特藻和G. tongyeonginum则与该群体距离较远。Hulburtia和Grammatodinium与化石甲藻Dapsilidinium亲缘关系较近，但它们的更高分类地位尚待确定。我们的结果强调了对裸甲藻多样性的低估，并强调了超微结构特征在理解其进化过程中的重要性。该论文2025年8月在Journal of Phycology在线发表。

三亚赫尔伯特藻