国家海洋局第三海洋研究所海洋微藻中心挂靠在海洋生物与生态实验室，以海洋微藻为主，兼顾淡水藻类。目前微藻中心保存的株系有100多株，50多种，大部分属于海洋甲藻和隐藻类。本中心侧重于海洋底栖甲藻和产毒甲藻的收集和保藏，可以为科研、教学提供相应的藻种服务。